Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRF9Q00978 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF9Q00978 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF9Q00978 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF9Q00978 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF9Q00978 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms