Protein–RNA interactions for Protein: P98077

SHC2, SHC-transforming protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC2P98077 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHC2P98077 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHC2P98077 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHC2P98077 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SHC2P98077 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHC2P98077 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHC2P98077 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHC2P98077 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHC2P98077 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHC2P98077 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHC2P98077 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SHC2P98077 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHC2P98077 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHC2P98077 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHC2P98077 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHC2P98077 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHC2P98077 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHC2P98077 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHC2P98077 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHC2P98077 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHC2P98077 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHC2P98077 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHC2P98077 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHC2P98077 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHC2P98077 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHC2P98077 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHC2P98077 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHC2P98077 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHC2P98077 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHC2P98077 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHC2P98077 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC2P98077 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC2P98077 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC2P98077 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC2P98077 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHC2P98077 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHC2P98077 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC2P98077 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC2P98077 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC2P98077 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHC2P98077 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC2P98077 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC2P98077 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC2P98077 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHC2P98077 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC2P98077 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHC2P98077 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC2P98077 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC2P98077 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC2P98077 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC2P98077 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC2P98077 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC2P98077 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC2P98077 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHC2P98077 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC2P98077 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC2P98077 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC2P98077 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC2P98077 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC2P98077 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHC2P98077 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC2P98077 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC2P98077 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC2P98077 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC2P98077 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC2P98077 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHC2P98077 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC2P98077 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC2P98077 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC2P98077 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC2P98077 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC2P98077 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC2P98077 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC2P98077 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC2P98077 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC2P98077 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC2P98077 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC2P98077 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC2P98077 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC2P98077 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC2P98077 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC2P98077 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC2P98077 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC2P98077 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC2P98077 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC2P98077 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC2P98077 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC2P98077 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC2P98077 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC2P98077 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC2P98077 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC2P98077 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC2P98077 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC2P98077 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC2P98077 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC2P98077 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC2P98077 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC2P98077 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC2P98077 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC2P98077 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms