Protein–RNA interactions for Protein: P85037

FOXK1, Forkhead box protein K1, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK1P85037 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXK1P85037 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXK1P85037 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXK1P85037 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXK1P85037 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 792.5 ms