Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF5P84085 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF5P84085 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF5P84085 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF5P84085 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF5P84085 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF5P84085 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF5P84085 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARF5P84085 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF5P84085 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF5P84085 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF5P84085 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF5P84085 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF5P84085 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARF5P84085 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARF5P84085 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARF5P84085 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF5P84085 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF5P84085 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF5P84085 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF5P84085 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF5P84085 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF5P84085 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF5P84085 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARF5P84085 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARF5P84085 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARF5P84085 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARF5P84085 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF5P84085 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF5P84085 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF5P84085 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF5P84085 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF5P84085 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARF5P84085 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF5P84085 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF5P84085 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF5P84085 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARF5P84085 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF5P84085 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF5P84085 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARF5P84085 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF5P84085 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF5P84085 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARF5P84085 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARF5P84085 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARF5P84085 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARF5P84085 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARF5P84085 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARF5P84085 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARF5P84085 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ARF5P84085 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARF5P84085 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARF5P84085 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARF5P84085 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARF5P84085 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARF5P84085 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARF5P84085 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARF5P84085 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF5P84085 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARF5P84085 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARF5P84085 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARF5P84085 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARF5P84085 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARF5P84085 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF5P84085 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARF5P84085 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARF5P84085 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARF5P84085 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARF5P84085 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARF5P84085 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARF5P84085 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARF5P84085 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARF5P84085 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF5P84085 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARF5P84085 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF5P84085 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF5P84085 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF5P84085 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARF5P84085 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF5P84085 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF5P84085 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF5P84085 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF5P84085 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARF5P84085 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF5P84085 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF5P84085 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF5P84085 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF5P84085 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF5P84085 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARF5P84085 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms