Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTRA4P83105 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HTRA4P83105 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTRA4P83105 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTRA4P83105 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms