Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTA1P68133 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTA1P68133 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTA1P68133 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTA1P68133 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTA1P68133 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms