Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAMP2P63027 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAMP2P63027 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAMP2P63027 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAMP2P63027 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAMP2P63027 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VAMP2P63027 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP2P63027 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP2P63027 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP2P63027 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAMP2P63027 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms