Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB1AP62820 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB1AP62820 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms