Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNRPFP62306 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNRPFP62306 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNRPFP62306 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SNRPFP62306 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNRPFP62306 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNRPFP62306 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNRPFP62306 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SNRPFP62306 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPFP62306 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPFP62306 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPFP62306 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SNRPFP62306 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPFP62306 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNRPFP62306 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPFP62306 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPFP62306 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPFP62306 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPFP62306 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNRPFP62306 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNRPFP62306 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNRPFP62306 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRPFP62306 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRPFP62306 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms