Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBASH3AP57075 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBASH3AP57075 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBASH3AP57075 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBASH3AP57075 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBASH3AP57075 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBASH3AP57075 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBASH3AP57075 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBASH3AP57075 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBASH3AP57075 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBASH3AP57075 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBASH3AP57075 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBASH3AP57075 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBASH3AP57075 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBASH3AP57075 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBASH3AP57075 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBASH3AP57075 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBASH3AP57075 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBASH3AP57075 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBASH3AP57075 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBASH3AP57075 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBASH3AP57075 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBASH3AP57075 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBASH3AP57075 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBASH3AP57075 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBASH3AP57075 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBASH3AP57075 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBASH3AP57075 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBASH3AP57075 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBASH3AP57075 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBASH3AP57075 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBASH3AP57075 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBASH3AP57075 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBASH3AP57075 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBASH3AP57075 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
UBASH3AP57075 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
UBASH3AP57075 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBASH3AP57075 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms