Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2BFSP57053 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2BFSP57053 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2BFSP57053 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms