Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN20P56880 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN20P56880 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN20P56880 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN20P56880 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms