Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV3P56539 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV3P56539 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV3P56539 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAV3P56539 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV3P56539 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV3P56539 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV3P56539 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAV3P56539 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV3P56539 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV3P56539 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV3P56539 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV3P56539 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAV3P56539 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV3P56539 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV3P56539 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV3P56539 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAV3P56539 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV3P56539 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAV3P56539 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV3P56539 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV3P56539 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV3P56539 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAV3P56539 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAV3P56539 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV3P56539 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV3P56539 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV3P56539 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV3P56539 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAV3P56539 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAV3P56539 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAV3P56539 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAV3P56539 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAV3P56539 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAV3P56539 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAV3P56539 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAV3P56539 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAV3P56539 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAV3P56539 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAV3P56539 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAV3P56539 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAV3P56539 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAV3P56539 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAV3P56539 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAV3P56539 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAV3P56539 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAV3P56539 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAV3P56539 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAV3P56539 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAV3P56539 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAV3P56539 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAV3P56539 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAV3P56539 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAV3P56539 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAV3P56539 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAV3P56539 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAV3P56539 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAV3P56539 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAV3P56539 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAV3P56539 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAV3P56539 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAV3P56539 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAV3P56539 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAV3P56539 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAV3P56539 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAV3P56539 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAV3P56539 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAV3P56539 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAV3P56539 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAV3P56539 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAV3P56539 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAV3P56539 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAV3P56539 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAV3P56539 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAV3P56539 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAV3P56539 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAV3P56539 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAV3P56539 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAV3P56539 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAV3P56539 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAV3P56539 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAV3P56539 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAV3P56539 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAV3P56539 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAV3P56539 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAV3P56539 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAV3P56539 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAV3P56539 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAV3P56539 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAV3P56539 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAV3P56539 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAV3P56539 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms