Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AP1S2P56377 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP1S2P56377 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP1S2P56377 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP1S2P56377 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AP1S2P56377 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms