Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA1P56199 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA1P56199 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA1P56199 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA1P56199 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms