Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52P55327 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52P55327 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52P55327 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52P55327 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TPD52P55327 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52P55327 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52P55327 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52P55327 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52P55327 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52P55327 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52P55327 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TPD52P55327 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPD52P55327 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPD52P55327 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPD52P55327 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPD52P55327 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPD52P55327 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TPD52P55327 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52P55327 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52P55327 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TPD52P55327 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52P55327 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52P55327 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52P55327 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52P55327 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52P55327 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52P55327 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52P55327 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TPD52P55327 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPD52P55327 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TPD52P55327 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TPD52P55327 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52P55327 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52P55327 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52P55327 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52P55327 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52P55327 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TPD52P55327 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPD52P55327 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPD52P55327 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPD52P55327 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPD52P55327 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TPD52P55327 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TPD52P55327 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52P55327 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52P55327 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52P55327 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52P55327 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52P55327 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52P55327 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52P55327 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPD52P55327 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPD52P55327 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPD52P55327 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52P55327 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52P55327 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52P55327 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52P55327 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52P55327 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52P55327 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPD52P55327 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPD52P55327 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPD52P55327 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPD52P55327 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPD52P55327 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPD52P55327 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPD52P55327 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPD52P55327 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPD52P55327 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52P55327 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52P55327 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPD52P55327 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPD52P55327 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPD52P55327 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPD52P55327 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPD52P55327 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPD52P55327 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TPD52P55327 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TPD52P55327 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52P55327 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TPD52P55327 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms