Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH11P55287 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH11P55287 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH11P55287 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH11P55287 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH11P55287 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH11P55287 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH11P55287 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH11P55287 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH11P55287 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH11P55287 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH11P55287 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH11P55287 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH11P55287 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH11P55287 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH11P55287 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH11P55287 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH11P55287 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH11P55287 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH11P55287 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH11P55287 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH11P55287 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH11P55287 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH11P55287 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH11P55287 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH11P55287 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH11P55287 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH11P55287 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH11P55287 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH11P55287 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH11P55287 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH11P55287 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH11P55287 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH11P55287 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH11P55287 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH11P55287 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH11P55287 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH11P55287 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH11P55287 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH11P55287 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH11P55287 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH11P55287 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH11P55287 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH11P55287 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH11P55287 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH11P55287 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH11P55287 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH11P55287 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH11P55287 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH11P55287 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH11P55287 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH11P55287 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH11P55287 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH11P55287 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH11P55287 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH11P55287 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH11P55287 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH11P55287 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH11P55287 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH11P55287 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH11P55287 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH11P55287 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH11P55287 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH11P55287 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH11P55287 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH11P55287 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH11P55287 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH11P55287 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH11P55287 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH11P55287 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH11P55287 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH11P55287 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH11P55287 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH11P55287 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH11P55287 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH11P55287 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH11P55287 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH11P55287 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH11P55287 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH11P55287 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH11P55287 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH11P55287 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH11P55287 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH11P55287 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH11P55287 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH11P55287 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH11P55287 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDH11P55287 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH11P55287 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH11P55287 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDH11P55287 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH11P55287 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH11P55287 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH11P55287 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH11P55287 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDH11P55287 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH11P55287 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH11P55287 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH11P55287 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDH11P55287 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms