Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP9P55211 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP9P55211 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP9P55211 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP9P55211 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP9P55211 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP9P55211 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP9P55211 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CASP9P55211 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP9P55211 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP9P55211 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP9P55211 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP9P55211 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP9P55211 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CASP9P55211 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP9P55211 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP9P55211 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP9P55211 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CASP9P55211 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP9P55211 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP9P55211 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CASP9P55211 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP9P55211 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP9P55211 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP9P55211 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP9P55211 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP9P55211 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP9P55211 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CASP9P55211 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CASP9P55211 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP9P55211 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CASP9P55211 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP9P55211 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP9P55211 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP9P55211 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP9P55211 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP9P55211 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CASP9P55211 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP9P55211 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP9P55211 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CASP9P55211 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP9P55211 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP9P55211 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CASP9P55211 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CASP9P55211 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP9P55211 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP9P55211 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP9P55211 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP9P55211 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP9P55211 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP9P55211 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASP9P55211 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP9P55211 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP9P55211 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP9P55211 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP9P55211 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP9P55211 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASP9P55211 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP9P55211 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP9P55211 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP9P55211 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP9P55211 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP9P55211 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP9P55211 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASP9P55211 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP9P55211 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASP9P55211 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP9P55211 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASP9P55211 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP9P55211 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP9P55211 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP9P55211 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP9P55211 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP9P55211 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CASP9P55211 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP9P55211 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP9P55211 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP9P55211 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CASP9P55211 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP9P55211 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP9P55211 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP9P55211 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP9P55211 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP9P55211 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms