Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC12A3P55017 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC12A3P55017 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC12A3P55017 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC12A3P55017 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC12A3P55017 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms