Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA8P53708 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGA8P53708 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGA8P53708 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGA8P53708 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGA8P53708 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms