Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3M2P53677 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
AP3M2P53677 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3M2P53677 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3M2P53677 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3M2P53677 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3M2P53677 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms