Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST2P52849 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST2P52849 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDST2P52849 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDST2P52849 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDST2P52849 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDST2P52849 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST2P52849 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST2P52849 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDST2P52849 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDST2P52849 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NDST2P52849 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST2P52849 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST2P52849 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NDST2P52849 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST2P52849 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDST2P52849 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST2P52849 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST2P52849 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST2P52849 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDST2P52849 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST2P52849 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST2P52849 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST2P52849 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NDST2P52849 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST2P52849 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST2P52849 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NDST2P52849 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NDST2P52849 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDST2P52849 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDST2P52849 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDST2P52849 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDST2P52849 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDST2P52849 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDST2P52849 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDST2P52849 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDST2P52849 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST2P52849 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST2P52849 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDST2P52849 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST2P52849 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST2P52849 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST2P52849 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST2P52849 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST2P52849 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDST2P52849 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDST2P52849 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST2P52849 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDST2P52849 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST2P52849 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST2P52849 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST2P52849 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NDST2P52849 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDST2P52849 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NDST2P52849 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDST2P52849 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST2P52849 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDST2P52849 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms