Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV2P52735 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV2P52735 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VAV2P52735 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV2P52735 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV2P52735 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV2P52735 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV2P52735 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV2P52735 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VAV2P52735 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV2P52735 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VAV2P52735 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV2P52735 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV2P52735 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV2P52735 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV2P52735 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV2P52735 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VAV2P52735 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV2P52735 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VAV2P52735 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV2P52735 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VAV2P52735 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV2P52735 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV2P52735 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV2P52735 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV2P52735 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VAV2P52735 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV2P52735 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV2P52735 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VAV2P52735 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV2P52735 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VAV2P52735 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV2P52735 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV2P52735 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV2P52735 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VAV2P52735 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV2P52735 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV2P52735 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV2P52735 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VAV2P52735 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV2P52735 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV2P52735 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV2P52735 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV2P52735 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV2P52735 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VAV2P52735 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV2P52735 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV2P52735 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV2P52735 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV2P52735 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VAV2P52735 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
VAV2P52735 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV2P52735 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV2P52735 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAV2P52735 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
VAV2P52735 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VAV2P52735 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV2P52735 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV2P52735 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV2P52735 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV2P52735 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAV2P52735 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV2P52735 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV2P52735 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAV2P52735 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV2P52735 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV2P52735 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV2P52735 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV2P52735 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAV2P52735 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV2P52735 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV2P52735 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV2P52735 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV2P52735 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAV2P52735 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV2P52735 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV2P52735 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV2P52735 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAV2P52735 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV2P52735 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV2P52735 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV2P52735 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV2P52735 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV2P52735 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV2P52735 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VAV2P52735 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VAV2P52735 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV2P52735 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV2P52735 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV2P52735 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV2P52735 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VAV2P52735 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms