Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KPNA1P52294 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KPNA1P52294 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KPNA1P52294 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KPNA1P52294 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KPNA1P52294 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms