Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
SMARCA2P51531 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC45.92■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC45.89■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
SMARCA2P51531 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC45.88■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SMARCA2P51531 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC45.75■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.92
SMARCA2P51531 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
SMARCA2P51531 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC45.65■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
SMARCA2P51531 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.6■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.57■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
SMARCA2P51531 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA2P51531 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms