Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPINT3P49223 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPINT3P49223 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPINT3P49223 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPINT3P49223 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms