Protein–RNA interactions for Protein: P48723

HSPA13, Heat shock 70 kDa protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA13P48723 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSPA13P48723 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPA13P48723 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA13P48723 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA13P48723 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HSPA13P48723 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA13P48723 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA13P48723 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA13P48723 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA13P48723 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms