Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNC1P48547 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNC1P48547 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCNC1P48547 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCNC1P48547 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms