Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX2P48378 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX2P48378 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX2P48378 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX2P48378 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX2P48378 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX2P48378 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX2P48378 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX2P48378 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFX2P48378 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFX2P48378 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX2P48378 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX2P48378 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX2P48378 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX2P48378 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX2P48378 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX2P48378 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX2P48378 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX2P48378 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX2P48378 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX2P48378 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX2P48378 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX2P48378 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX2P48378 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX2P48378 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX2P48378 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX2P48378 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX2P48378 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX2P48378 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RFX2P48378 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RFX2P48378 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX2P48378 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX2P48378 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX2P48378 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX2P48378 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX2P48378 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX2P48378 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RFX2P48378 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX2P48378 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX2P48378 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX2P48378 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX2P48378 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX2P48378 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RFX2P48378 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX2P48378 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX2P48378 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX2P48378 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX2P48378 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX2P48378 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX2P48378 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX2P48378 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RFX2P48378 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX2P48378 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX2P48378 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RFX2P48378 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX2P48378 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX2P48378 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX2P48378 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX2P48378 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RFX2P48378 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RFX2P48378 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX2P48378 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX2P48378 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX2P48378 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX2P48378 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX2P48378 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX2P48378 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX2P48378 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RFX2P48378 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX2P48378 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX2P48378 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX2P48378 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX2P48378 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RFX2P48378 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX2P48378 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX2P48378 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RFX2P48378 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RFX2P48378 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms