Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TM4SF4P48230 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TM4SF4P48230 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TM4SF4P48230 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TM4SF4P48230 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms