Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA8P48165 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA8P48165 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA8P48165 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA8P48165 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA8P48165 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA8P48165 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA8P48165 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA8P48165 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA8P48165 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA8P48165 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA8P48165 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA8P48165 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA8P48165 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA8P48165 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA8P48165 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA8P48165 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA8P48165 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA8P48165 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA8P48165 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA8P48165 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA8P48165 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA8P48165 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA8P48165 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA8P48165 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA8P48165 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA8P48165 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA8P48165 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA8P48165 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA8P48165 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA8P48165 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA8P48165 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA8P48165 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA8P48165 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA8P48165 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA8P48165 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA8P48165 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA8P48165 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA8P48165 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA8P48165 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA8P48165 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA8P48165 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA8P48165 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA8P48165 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJA8P48165 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJA8P48165 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJA8P48165 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJA8P48165 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJA8P48165 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA8P48165 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA8P48165 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA8P48165 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA8P48165 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA8P48165 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA8P48165 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA8P48165 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA8P48165 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA8P48165 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA8P48165 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA8P48165 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA8P48165 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA8P48165 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA8P48165 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA8P48165 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJA8P48165 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA8P48165 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA8P48165 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA8P48165 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA8P48165 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA8P48165 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA8P48165 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA8P48165 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA8P48165 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA8P48165 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA8P48165 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA8P48165 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA8P48165 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA8P48165 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA8P48165 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA8P48165 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA8P48165 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA8P48165 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJA8P48165 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJA8P48165 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJA8P48165 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJA8P48165 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJA8P48165 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJA8P48165 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJA8P48165 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJA8P48165 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJA8P48165 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GJA8P48165 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA8P48165 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA8P48165 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA8P48165 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJA8P48165 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA8P48165 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA8P48165 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJA8P48165 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJA8P48165 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms