Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-1P43699 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-1P43699 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-1P43699 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NKX2-1P43699 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-1P43699 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-1P43699 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-1P43699 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NKX2-1P43699 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NKX2-1P43699 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKX2-1P43699 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms