Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATA4P43694 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GATA4P43694 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GATA4P43694 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GATA4P43694 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GATA4P43694 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GATA4P43694 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATA4P43694 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GATA4P43694 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GATA4P43694 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GATA4P43694 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATA4P43694 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATA4P43694 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATA4P43694 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GATA4P43694 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GATA4P43694 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GATA4P43694 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GATA4P43694 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GATA4P43694 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GATA4P43694 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GATA4P43694 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATA4P43694 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATA4P43694 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GATA4P43694 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GATA4P43694 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GATA4P43694 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GATA4P43694 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA4P43694 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA4P43694 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA4P43694 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA4P43694 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA4P43694 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GATA4P43694 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA4P43694 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA4P43694 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA4P43694 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA4P43694 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA4P43694 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GATA4P43694 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA4P43694 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GATA4P43694 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA4P43694 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA4P43694 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA4P43694 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA4P43694 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA4P43694 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GATA4P43694 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GATA4P43694 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA4P43694 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA4P43694 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GATA4P43694 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA4P43694 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA4P43694 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA4P43694 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA4P43694 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GATA4P43694 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATA4P43694 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATA4P43694 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GATA4P43694 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GATA4P43694 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATA4P43694 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATA4P43694 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATA4P43694 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATA4P43694 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GATA4P43694 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATA4P43694 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATA4P43694 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATA4P43694 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATA4P43694 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GATA4P43694 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATA4P43694 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GATA4P43694 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATA4P43694 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATA4P43694 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATA4P43694 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATA4P43694 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATA4P43694 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GATA4P43694 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GATA4P43694 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA4P43694 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA4P43694 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA4P43694 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GATA4P43694 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA4P43694 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA4P43694 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA4P43694 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GATA4P43694 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA4P43694 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA4P43694 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA4P43694 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms