Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL35P42766 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL35P42766 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL35P42766 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL35P42766 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL35P42766 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL35P42766 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL35P42766 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL35P42766 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL35P42766 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL35P42766 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL35P42766 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL35P42766 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL35P42766 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL35P42766 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL35P42766 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL35P42766 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL35P42766 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL35P42766 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL35P42766 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL35P42766 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL35P42766 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL35P42766 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL35P42766 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL35P42766 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL35P42766 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL35P42766 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL35P42766 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL35P42766 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL35P42766 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL35P42766 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL35P42766 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL35P42766 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL35P42766 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL35P42766 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL35P42766 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL35P42766 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL35P42766 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL35P42766 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL35P42766 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL35P42766 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL35P42766 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL35P42766 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL35P42766 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL35P42766 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL35P42766 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL35P42766 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL35P42766 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL35P42766 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL35P42766 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL35P42766 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL35P42766 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL35P42766 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL35P42766 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL35P42766 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL35P42766 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL35P42766 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL35P42766 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL35P42766 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL35P42766 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL35P42766 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL35P42766 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL35P42766 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL35P42766 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL35P42766 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL35P42766 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL35P42766 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL35P42766 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL35P42766 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL35P42766 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL35P42766 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL35P42766 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL35P42766 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL35P42766 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL35P42766 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL35P42766 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL35P42766 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL35P42766 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL35P42766 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL35P42766 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL35P42766 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms