Protein–RNA interactions for Protein: P42677

RPS27, 40S ribosomal protein S27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27P42677 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27P42677 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27P42677 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27P42677 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS27P42677 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27P42677 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27P42677 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS27P42677 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27P42677 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS27P42677 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27P42677 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27P42677 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27P42677 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27P42677 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27P42677 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27P42677 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS27P42677 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27P42677 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27P42677 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27P42677 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27P42677 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27P42677 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS27P42677 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS27P42677 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27P42677 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27P42677 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS27P42677 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27P42677 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27P42677 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS27P42677 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27P42677 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27P42677 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27P42677 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27P42677 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS27P42677 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27P42677 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27P42677 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27P42677 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS27P42677 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27P42677 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27P42677 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27P42677 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27P42677 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27P42677 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27P42677 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS27P42677 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27P42677 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27P42677 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27P42677 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27P42677 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27P42677 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS27P42677 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27P42677 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27P42677 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27P42677 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27P42677 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS27P42677 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27P42677 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27P42677 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27P42677 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS27P42677 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27P42677 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27P42677 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27P42677 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27P42677 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27P42677 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS27P42677 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27P42677 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27P42677 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27P42677 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27P42677 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS27P42677 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS27P42677 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27P42677 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27P42677 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27P42677 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27P42677 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS27P42677 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27P42677 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27P42677 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27P42677 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27P42677 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS27P42677 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27P42677 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS27P42677 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27P42677 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS27P42677 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27P42677 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27P42677 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27P42677 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS27P42677 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27P42677 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27P42677 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27P42677 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS27P42677 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27P42677 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27P42677 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27P42677 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS27P42677 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS27P42677 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168 ms