Protein–RNA interactions for Protein: P41968

MC3R, Melanocortin receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC3RP41968 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC3RP41968 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC3RP41968 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC3RP41968 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MC3RP41968 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MC3RP41968 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MC3RP41968 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MC3RP41968 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MC3RP41968 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC3RP41968 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC3RP41968 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MC3RP41968 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC3RP41968 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MC3RP41968 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC3RP41968 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC3RP41968 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MC3RP41968 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MC3RP41968 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MC3RP41968 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MC3RP41968 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MC3RP41968 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC3RP41968 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC3RP41968 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC3RP41968 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MC3RP41968 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC3RP41968 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MC3RP41968 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MC3RP41968 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MC3RP41968 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC3RP41968 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC3RP41968 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MC3RP41968 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC3RP41968 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC3RP41968 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC3RP41968 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC3RP41968 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC3RP41968 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MC3RP41968 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MC3RP41968 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MC3RP41968 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MC3RP41968 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MC3RP41968 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MC3RP41968 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC3RP41968 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC3RP41968 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC3RP41968 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MC3RP41968 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC3RP41968 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC3RP41968 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC3RP41968 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC3RP41968 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MC3RP41968 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MC3RP41968 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC3RP41968 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC3RP41968 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC3RP41968 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC3RP41968 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC3RP41968 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC3RP41968 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC3RP41968 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MC3RP41968 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC3RP41968 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC3RP41968 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC3RP41968 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC3RP41968 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC3RP41968 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MC3RP41968 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC3RP41968 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC3RP41968 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MC3RP41968 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MC3RP41968 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MC3RP41968 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MC3RP41968 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MC3RP41968 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MC3RP41968 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MC3RP41968 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MC3RP41968 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MC3RP41968 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MC3RP41968 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MC3RP41968 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MC3RP41968 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms