Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNFP41002 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNFP41002 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNFP41002 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNFP41002 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNFP41002 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNFP41002 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNFP41002 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNFP41002 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNFP41002 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNFP41002 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNFP41002 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNFP41002 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNFP41002 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNFP41002 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNFP41002 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNFP41002 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNFP41002 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNFP41002 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNFP41002 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNFP41002 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNFP41002 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNFP41002 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNFP41002 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNFP41002 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNFP41002 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNFP41002 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNFP41002 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNFP41002 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNFP41002 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNFP41002 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNFP41002 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNFP41002 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNFP41002 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNFP41002 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNFP41002 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNFP41002 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCNFP41002 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNFP41002 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNFP41002 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNFP41002 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNFP41002 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNFP41002 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNFP41002 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNFP41002 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNFP41002 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNFP41002 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNFP41002 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNFP41002 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNFP41002 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNFP41002 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNFP41002 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNFP41002 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNFP41002 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNFP41002 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNFP41002 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNFP41002 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNFP41002 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNFP41002 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNFP41002 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNFP41002 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNFP41002 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNFP41002 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNFP41002 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNFP41002 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNFP41002 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNFP41002 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNFP41002 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNFP41002 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNFP41002 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNFP41002 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNFP41002 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNFP41002 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNFP41002 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNFP41002 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNFP41002 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNFP41002 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNFP41002 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNFP41002 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNFP41002 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNFP41002 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNFP41002 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNFP41002 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNFP41002 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCNFP41002 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNFP41002 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNFP41002 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNFP41002 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNFP41002 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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