Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP8P40818 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP8P40818 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP8P40818 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP8P40818 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP8P40818 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP8P40818 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP8P40818 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP8P40818 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP8P40818 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP8P40818 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP8P40818 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP8P40818 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP8P40818 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP8P40818 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP8P40818 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP8P40818 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP8P40818 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP8P40818 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP8P40818 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP8P40818 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP8P40818 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP8P40818 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP8P40818 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP8P40818 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP8P40818 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP8P40818 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP8P40818 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP8P40818 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP8P40818 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP8P40818 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP8P40818 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP8P40818 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP8P40818 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP8P40818 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP8P40818 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP8P40818 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP8P40818 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP8P40818 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP8P40818 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP8P40818 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP8P40818 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP8P40818 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP8P40818 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP8P40818 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP8P40818 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP8P40818 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP8P40818 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP8P40818 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP8P40818 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP8P40818 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP8P40818 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP8P40818 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP8P40818 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP8P40818 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP8P40818 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP8P40818 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP8P40818 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP8P40818 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP8P40818 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP8P40818 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP8P40818 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP8P40818 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP8P40818 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP8P40818 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP8P40818 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP8P40818 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP8P40818 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP8P40818 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP8P40818 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP8P40818 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP8P40818 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP8P40818 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP8P40818 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP8P40818 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP8P40818 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP8P40818 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP8P40818 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP8P40818 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP8P40818 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP8P40818 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP8P40818 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms