Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1E1P36543 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1E1P36543 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1E1P36543 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1E1P36543 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms