Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GJC1P36383 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GJC1P36383 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJC1P36383 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJC1P36383 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJC1P36383 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJC1P36383 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GJC1P36383 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJC1P36383 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GJC1P36383 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJC1P36383 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJC1P36383 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJC1P36383 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GJC1P36383 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GJC1P36383 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJC1P36383 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GJC1P36383 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJC1P36383 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJC1P36383 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GJC1P36383 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJC1P36383 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJC1P36383 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GJC1P36383 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJC1P36383 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJC1P36383 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJC1P36383 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GJC1P36383 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GJC1P36383 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJC1P36383 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJC1P36383 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJC1P36383 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJC1P36383 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJC1P36383 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJC1P36383 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJC1P36383 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJC1P36383 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJC1P36383 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJC1P36383 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJC1P36383 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJC1P36383 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJC1P36383 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJC1P36383 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJC1P36383 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJC1P36383 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJC1P36383 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJC1P36383 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJC1P36383 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJC1P36383 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJC1P36383 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJC1P36383 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJC1P36383 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJC1P36383 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJC1P36383 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJC1P36383 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJC1P36383 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJC1P36383 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJC1P36383 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJC1P36383 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJC1P36383 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJC1P36383 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJC1P36383 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJC1P36383 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJC1P36383 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJC1P36383 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJC1P36383 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJC1P36383 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJC1P36383 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJC1P36383 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJC1P36383 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJC1P36383 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJC1P36383 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJC1P36383 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJC1P36383 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJC1P36383 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJC1P36383 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJC1P36383 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJC1P36383 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJC1P36383 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJC1P36383 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJC1P36383 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJC1P36383 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJC1P36383 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJC1P36383 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJC1P36383 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJC1P36383 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJC1P36383 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJC1P36383 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJC1P36383 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GJC1P36383 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJC1P36383 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJC1P36383 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GJC1P36383 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms