Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIMP3P35625 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMP3P35625 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP3P35625 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms