Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCGF2P35227 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCGF2P35227 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF2P35227 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF2P35227 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF2P35227 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms