Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC12P31275 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXC12P31275 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC12P31275 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXC12P31275 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms