Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA6P31267 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA6P31267 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA6P31267 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HOXA6P31267 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXA6P31267 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms