Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HTR1FP30939 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1FP30939 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1FP30939 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1FP30939 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms