Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MARCKSP29966 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCKSP29966 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MARCKSP29966 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCKSP29966 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARCKSP29966 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms