Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC5P28715 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERCC5P28715 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERCC5P28715 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERCC5P28715 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERCC5P28715 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms