Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NFKBIAP25963 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NFKBIAP25963 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFKBIAP25963 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms