Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM3P25205 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM3P25205 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM3P25205 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCM3P25205 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM3P25205 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM3P25205 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCM3P25205 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM3P25205 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCM3P25205 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM3P25205 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM3P25205 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCM3P25205 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM3P25205 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM3P25205 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM3P25205 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM3P25205 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM3P25205 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCM3P25205 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCM3P25205 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCM3P25205 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCM3P25205 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCM3P25205 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCM3P25205 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MCM3P25205 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM3P25205 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM3P25205 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM3P25205 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM3P25205 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM3P25205 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MCM3P25205 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCM3P25205 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCM3P25205 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCM3P25205 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MCM3P25205 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCM3P25205 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCM3P25205 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCM3P25205 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCM3P25205 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MCM3P25205 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCM3P25205 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MCM3P25205 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCM3P25205 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCM3P25205 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCM3P25205 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MCM3P25205 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MCM3P25205 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCM3P25205 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCM3P25205 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MCM3P25205 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM3P25205 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM3P25205 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM3P25205 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM3P25205 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCM3P25205 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCM3P25205 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCM3P25205 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCM3P25205 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCM3P25205 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCM3P25205 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM3P25205 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM3P25205 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM3P25205 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCM3P25205 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM3P25205 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM3P25205 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCM3P25205 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM3P25205 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM3P25205 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM3P25205 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MCM3P25205 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM3P25205 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM3P25205 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM3P25205 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM3P25205 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCM3P25205 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM3P25205 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM3P25205 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM3P25205 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCM3P25205 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM3P25205 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM3P25205 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM3P25205 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM3P25205 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM3P25205 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM3P25205 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM3P25205 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCM3P25205 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCM3P25205 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCM3P25205 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM3P25205 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM3P25205 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCM3P25205 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM3P25205 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM3P25205 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM3P25205 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM3P25205 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCM3P25205 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM3P25205 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM3P25205 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms