Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP5F1P24539 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP5F1P24539 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP5F1P24539 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP5F1P24539 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms